如何使用DNase I减少单细胞悬液中的细胞团块
制备单细胞悬液是细胞分选成功的关键,但是如果您的样本有细胞团块,可能会导致较低的回收率并且干扰对目的细胞的标记。当样本被反复冻融或者在经过酶分解组织后,有时会出现细胞团块。这些细胞团块的产生是因为环境压力可以加速样本内细胞的死亡,导致从即将凋亡的细胞中释放出可以将周围细胞粘合在一起的 "粘性"DNA分子。本实验流程描述了如何使用DNase I处理您的样本以减少单细胞悬液中的细胞团块。
实验材料
- DNase I溶液(1 mg/mL,产品号 #07900)
- 培养基溶液或不含EDTA的缓冲液(如改良版HBSS (不含Ca++和Mg++) ,产品号 #37250)
- 胎牛血清(FBS)
- 两个50 mL锥形管(如Falcon®锥形管,50 mL,产品号 #38010)
- 细胞过滤器(如70 μm倒置过滤器,大号,产品号 #27260)
实验流程
注意:如果您下游需要提取DNA或RNA,则不能使用DNase减少细胞团块。
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在37°C水浴锅中快速旋转冻存管以解冻细胞。将解冻的细胞转移至灭菌的50 mL锥形管中。
可选:先使用移液器在锥形管中加入0.25到0.5 mL DNase I溶液,再将解冻的细胞转移至管中。 - 缓慢逐滴加入10 - 15 mL的含10% FBS的培养基或缓冲液,同时轻轻转动试管。
- 用1 mL含10% FBS的培养基或缓冲液(例如PBS或者HBSS)冲洗冻存管,以收集管中残留的细胞,然后将培养基或缓冲液转移到新的试管中。
- 用含10% FBS的培养基或缓冲液补满50 mL试管。轻轻涡旋混匀。
- 室温下(15 - 25°C),300 x g,离心10分钟后收集细胞。
- 小心地弃去尽可能多的上清液,尽量不要搅动细胞沉淀。轻轻敲打管壁来重新悬浮沉淀。
- 如果细胞看上去成团块状,计算需要加入样本的DNase I达到终浓度为100 μg/mL所需的体积,逐滴加入DNase I并同时轻轻转动试管混匀。在室温下孵育15分钟。
- 加入25 mL含2% FBS的培养基或缓冲液清洗细胞。轻轻倒置试管混匀然后离心(室温下,300 x g,10分钟)。弃去尽可能多的上清液,然后重新温和地重悬沉淀。
- 如果细胞看上去仍然成团块状,使用一个37 - 70 µm的细胞滤网过滤样本并移入新的锥形管中。使用含2% FBS的培养基或缓冲液洗涤试管,然后使用细胞滤网过滤,重复三次。
- 得到的单细胞悬液可以立即进行细胞计数和进一步的下游应用,例如细胞分选。
请注意:如果是对DNase比较敏感的下游应用(例如造血细胞集落检测),进行细胞计数前再使用恰当的检测缓冲液洗涤(不含DNase)细胞一次。