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hPSC基因检测试剂盒的技术窍门和常见问题

hPSC基因检测试剂盒的技术窍门和常见问题

  • Document # 27130
  • Version 1.1.0
  • 8/20/24

本文档包括hPSC基因检测试剂盒的技术窍门和常见问题,应与产品信息表(PIS,文档号 #DX22330)一起参考使用。

关键步骤

  • 第一次使用hPSC基因检测试剂盒,在对大规模的样本进行检测前,最好使用Genomic DNA Control和1-2样本进行实验,对整个实验流程进行熟悉。
  • 按照PIS的要求,对混合物进行充分涡旋(每个样本5秒钟)。
  • 使用移液枪进行移液需要精准和小心。当检测多种样本时,推荐使用排枪。

常规窍门

当第一次使用本试剂盒时

  1. 在进行实验或准备qPCR Master Mix + Dye时,仔细阅读产品说明书(PIS)。
  2. 第一次进行实验时,应当检测Genomic DNA Control和最多1-2个样本。当您对操作流程熟悉后,并且实验的重现性高时,再提高样本数量。
  3. 将加样板的计划表格提前准备好,加样时放在面前参考。

涡旋,涡旋,涡旋!

  1. 当使用DNA时,我们通常不会进行涡旋,因为它可能会导致DNA切断。虽然我们不建议涡旋genomic DNA样本的母液,但将DNA和Master Mix + Dye溶液(在步骤C5中制备)彻底涡旋5秒钟非常关键。这将有助于减少复孔之间的结果差异。
  2. 同样地,步骤D3中制备的样本也应通过涡旋充分混合(每个样品5秒)。这同样有助于减少复孔间的结果差异。

Genomic DNA样本制备

  1. 每次反应中的Genomic DNA量可以增加;在某些情况下,这可以提高重复实验间的重现性。
    如,与其使用含有290 ng的58 μL样本(步骤 C.4),可使用含有580ng或870 ng的58 μL样本。
  2. 混合Genomic DNA和Master Mix + Dye,在C5结束时准备,在加样前涡旋均匀(每个样本5秒)。
  3. 使用适当的方法确定Genomic DNA样品的浓度和质量。GenomicDNA样品的吸光度比应在A260/280~1.8-2.0和A260/230~1.9-2.2的范围内。
  4. 如果样品DNA的浓度低(<5 ng/ μL),在使用hPSC基因检测试剂盒进行分析之前,使用乙醇沉淀或其他合适的方法进行浓缩可能会有帮助。检测浓度过低的DNA样本的实验重复性可能会很差并且导致难以解释的结果。

Genetic Assays

  1. 引物探针的冻干粉在运输过程中可能已经分散,因此在重悬前进行离心是非常重要的。最好的情况下,重新将冻干粉沉降到管低,并直接将TE重悬缓冲液加入冻干粉上。
  2. 实验前将实验体系混合均匀非常重要,尤其是在分装引物前。可在离心后轻弹离心管。
  3. 分装时要小心;当从母液移液至稀释后的样本时,接触母液一定要使用干净的枪头,避免引物探针间的交叉污染。

常见问题

qPCR反应失败/没有扩增信号

所有反应均没有扩增信号:

  • qPCR Master Mix(2X)中ROX Reference Dye未加入或加入量不正确。
    注意:检查qPCR Master Mix(2X)中添加了适量的ROX Reference Dye。
  • 使用了错误的cycling条件。
    注意:如果不确定机器需要哪种cycling条件,请使用PIS中提供的标准cycling时间。

个别反应没有扩增信号:

  • 反应中缺少一种或多种组分,包括genomic DNA,qPCR Master Mix(2X),ROX Reference Dye或Genetic Assay。
    注意:当混匀所有反应体系时;在边缘进行标记,标识是否所有的孔都有加入。
  • 在qPCR软件中选择了错误的孔。
    注意:有些qPCR机器使用的软件需要预先选择孔及其内容;在执行qPCR之前请检查是否选择了正确的孔。

复孔间的实验结果差异较大

  • 样本/试剂加入量不精确。
    注意:移液枪需要日常维护和校准。
  • 试剂未充分混匀/涡旋。
    注意:请按照PIS中的说明,混合物应使用涡旋的方式充分混匀。
  • 混合物体积不够。
    注意:如果操作的得当,步骤C中制备的genomic DNA + PCR Master Mix混合物和步骤D中制备的Genetic Assay是过量的,足够实验所用。
  • qPCR板中试剂加入不正确。
    注意:当在qPCR板中加入试剂时要小心;DNA加入量不精确会影响扩增系数。
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