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间充质干细胞 (MSC) 是从骨髓、脂肪、脐带血和其他组织中分离的成纤维细胞样细胞。 查看更多 由于MSC在组织中出现的频率较低，因此可能需要从混合细胞群中富集MSC。目前尚无报道能够分离MSC的单一、独特标记，而是利用多种复合细胞表面表型。因此，典型的分离方法采用通过去除不需要的细胞类型来富集的策略。
从人类骨髓或小鼠密质骨中提取未处理的间充质干细胞，或使用细胞分离试剂盒从人类骨髓中筛选出CD271+ MSC。或者，选择用于MSC研究的原代细胞产品，例如新鲜全脐带血。
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